Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms