Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BlmO88700 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BlmO88700 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BlmO88700 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BlmO88700 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BlmO88700 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms