Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms