Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3aO88508 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms