Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt1O88346 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms