Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms