Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms