Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxq1O70220 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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