Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms