Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad51dO55230 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms