Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChkbO55229 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms