Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms