Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms