Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrxO55103 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrxO55103 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrxO55103 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrxO55103 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrxO55103 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms