Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1bO55017 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms