Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LatO54957 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LatO54957 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LatO54957 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LatO54957 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LatO54957 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LatO54957 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LatO54957 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LatO54957 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms