Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6bO54951 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6bO54951 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms