Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnajb6O54946 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms