Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn5O54942 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms