Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lhx8O35652 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lhx8O35652 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lhx8O35652 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms