Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms