Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms