Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms