Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Foxd2O35392 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Foxd2O35392 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms