Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms