Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih1O35372 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih1O35372 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih1O35372 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih1O35372 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih1O35372 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms