Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna6O35345 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna6O35345 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms