Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d1bO35324 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms