Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfrsf11aO35305 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf11aO35305 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf11aO35305 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf11aO35305 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf11aO35305 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms