Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cx3cl1O35188 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms