Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms