Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Kcns1O35173 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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