Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1aO35134 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms