Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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H2-Q1O19441 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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H2-Q1O19441 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Q1O19441 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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H2-Q1O19441 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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H2-Q1O19441 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q1O19441 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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H2-Q1O19441 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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H2-Q1O19441 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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H2-Q1O19441 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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H2-Q1O19441 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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H2-Q1O19441 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q1O19441 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q1O19441 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q1O19441 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q1O19441 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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H2-Q1O19441 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms