Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms