Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms