Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps1O08983 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hps1O08983 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hps1O08983 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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