Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EllO08856 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EllO08856 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EllO08856 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms