Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barx2O08686 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Barx2O08686 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms