Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MttpO08601 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MttpO08601 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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MttpO08601 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MttpO08601 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MttpO08601 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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