Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltaO08585 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltaO08585 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltaO08585 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltaO08585 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CltaO08585 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CltaO08585 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CltaO08585 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltaO08585 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltaO08585 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms