Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms