Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna5O08543 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms