Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r88L7N1W8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms