Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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