Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms