Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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