Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC024978J3QPC3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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BC024978J3QPC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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