Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc180J3QNE4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc180J3QNE4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms