Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms